自分は、ｈｔｍｌとスタイルシートは、手書きでも多少は書けるのですが、PHPは数えるほどしか触ったことがありません（ほぼ素人）。ですが、背景の色とか、サイト名が表示されている部分、すぐ下のメニューボタン等の高さを変えたりしたいと思っています。

1）具体的には、どのフォルダーの何て言うファイルに手を加えれば良いのでしょうか？　違った絵柄も入れてみたりしたいです。

2）次のバージョンで上書きされない為には、どうすれば良いのでしょうか？

フォルダ名、ファイル名を教えて頂ければ、後は自分で努力します。御面倒でしょうが、教えてくださいませ。