開発フォーラムにて再度質問させていただきたいと思います。
宜しくお願いいたします。

「配送希望時間帯」のドロップダウンメニューがブランクになってしまいます。
手順が間違っていたのかと思い、商品を削除→再度配送設定をやり直しても治らず、
サーバーからワードプレスとデータベースを一度削除し、まっさらの状態から
Welcartの設定までをしたのですが、改善されませんでした。

何か原因などがお分かりでしたら、お教えいただけますでしょうか。
宜しくお願いいたします。

ヘッダ部分にJavaScript の出力がないのは、拙サイトでは 『Head Cleaner』 というプラグインを利用しているためです。

http://wppluginsj.sourceforge.jp/head-cleaner/
内の JavaScript を、フッタ領域に移動して、複数の JavaScript を結合･圧縮して高速化するプラグインです。
プラグインを追加するたびに、ヘッダにドンドン追加されていくJavaScript やら CSS やらをすっきり整理してくれるので重宝していましたが････なるほど、これが原因でしょうか。

週末にテストを行ってみます。
ありがとうございました。

カートページを進んでいくと、サイドバーにメインのコンテンツがそのまま表示されてしまっていました。つまり同じものが2つ表示されていると言うことです。これはJavaScript に影響を及ぼすので対処しなくてはいけません。
また、ヘッダ部分にJavaScript の出力が全くありませんでした。

これらの原因の特定はこちらでは確認できませんが、恐らくテーマの問題ではないかと思います。header.php、sidebar.php などを良く確認してみてください。

Welcart の設定情報が壊れてしまったのは、恐らくMySQL4 からMySQL5 への移行の際に起こった問題かと思います。

まずは、Welcart Default テーマ（最新版）を使って動作テストを行ってください。

ｖ0.7.1 へアップグレード後、商品をそのまま更新しましたが、やはりブランクのままです。
すみませんが、よろしくお願いします。

もし、商品登録後に配送設定を変更しているようでしたら、商品を一度そのまま更新してください。
配送設定

『現在のDevelopment Version』の件ですが、
http://wordpress.org/extend/plugins/usc-e-shop/download/
に置かれている、『Development Version』でいいのでしょうか。

http://www.welcart.com/community/archives/1356
を拝見しましたら、
>Development Version は現在のリリース版と同じバージョン番号なので区別がつきません。ご注意ください。
とあります。
Current Version　の直下にある
0.7.1
でしょうか。