私のメーラーはThunderbird3なのですが、
メッセージリストペインで見るときは日本時間に変換されて表示されるのですが、
メッセージを表示させると、標準時が表示されてしまうので、
少し気持ち悪かったのです。

ですが、たしかに、見る限りメールのヘッダはすべて+0000になっているようですね。
これはなんともしようがありませんね。

お返事ありがとうございました。
どうぞこれからもよろしくお願いいたします。

確認したいのですが、時刻が標準時になっているのはメールヘッダであってメーラーの日時は正常ということでよろしいでしょうか。

WordPressのログインの際の「パスワードをお忘れですか ?」からメールを受信してみてください。こちらでもテストしてみましたがwordpressが送信するメールはみんなそうなっているような気がします。
Welcartもwp_mailを使用していますのでWordPressがそうであれば今のところ直しようが無いかもしれません。