ひとまず思い描いていた形がほぼできあがったので、OPENしました。

泰八 は伝統工芸品を販売しています。現在は江戸切子をラインナップ。
http://tai8.jp

商品は手に入る、PHPのスキルも（それなりに）ある、デザインは…（失笑
というところで、最初はEC-CUBEを嫌々ながら使おうかな…と思っていましたが、
Welcartを知り、WordpressならPlugin開発もできるしこれでいこう！と。

カスタマイズした、というほどではありませんが…

1. 商品ページには同種の商品（関連商品）を表示させる
   • Simple Tags の関連投稿を使っています。
2. 決済や配送についてはウィジェットを作り全ページに表示
3. カテゴリ表示では品目数・ページ数を表示。
   • WP Page Numbersを使用
   • 価格順・所属子カテゴリ順などに並び替えたい…
4. 商品カテゴリー複合検索 のカスタマイズ
   • 子・孫カテゴリが多いため、デフォルトでは【商品ジャンル】に子・孫カテゴリが表示されてしまう
5. Welcart デフォルトテーマからのデザイン変更
   1. 各ページ、パンくずリストを表示（Breadcrumb NavXT 使用）
   2. 「商品ジャンル」以下をメニューバーに配置、子・孫カテゴリはマウスオーバー表示
   3. カテゴリページは3カラムに、写真・商品名・価格のみ表示（楽天ぽく）
   4. 商品ページの2枚目以降の写真を左側に表示（今は全商品1枚ずつのみですが）
6. パーマリンクの変更
   • URLに含まれる文字列もSEOに有効というのを信じてるので、/archives/%post_id%/%postname% とした
   • 宣伝の際、長くなってしまうが、URL短縮サービスを使うのはSEO的に不利な気がする
     • Short link maker で解決。Twitterなどでの宣伝が可能に。
     • （それを見越して短いドメイン名に）
7. ルミーズ クレジット決済モジュール開発（とりあえず一括払いのみ）
   • 開発したけどまだ決済できません（＞＜

といったところでしょうか。長くなってしまいました。
テーマだけでなくWelcart本体のソースもガリガリいじってしまったので、バージョンUPできなさそうです…

他には、通常のWordpress使用時のようにXML SitemapやGoogle Analytics for WordPress、TinyMCE Advanced を入れています。

なお、全く別ジャンルの商品もネットショップ作ってくれないかという話が来ているので、そちらも開発できればお知らせしたいと思っています。