Warning表示が消えた件ですが、やったことは他のサイトで別件で出ていたのですが、
1.ルート階層にtmpフォルダを作成
2.wp-admin内にphp.iniを作成。
php.iniの内容は session.save_path = /home/ユーザー名/tmp
これをやったから消えたのかと思い、調査のために再度上記を削除して時間をおいて何度か再起動、再確認を行ないました。
しかし、上記を削除した現在でもWarningは出ず、特に問題なく動いています。
キャッシュが残っていたか何かの自爆エラーだったかもしれません。
お騒がせいたしました。
ありがとうございます。