というのも該当ファイルでは「.menu-item-has-children」の
クラス名がついたコードの制御（span）のみの様な気がするのですが
そのほかに必要なファイルがあるのでしょうか？
グローバルナビ同様のメニューをヘッダーナビに設定し、コード確認をすると
「.menu-item-has-children」のクラスは付加されておりますが
アコーディオン化はされませんでした。
function.phpやその他のファイルを確認しましたが
該当のファイルが見つけられませんでした。
そもそもアコーディオン化はstyle.cssでの設定なのでしょうか？
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