解決しました。
商品詳細ページに、商品を出力するループの前にもう一つ、商品一覧を出力するループを作成していたのですが（スライドです）、どうやらこれが原因でした。
商品一覧を出力する自作関数内で下記記述が足りてなく、結果２つ目のループでサムネイルが表示されていたようです。
（query_postsでメインループを変更し、wp_reset_query();でリセットしていたのですが…）
usces_remove_filter();
usces_the_item();
これらを追記することでthe_content()でのサムネイル表示が無くなりました。
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