共通オプションの設定変更後、商品に対して再適用していない。

設定済の共通オプションのセレクト値を追加・削除など変更を行う場合、既に紐づけされている商品に対しては一旦登録している該当のオプションを削除し、再度登録し直してみてください。

上記の要因から次の様な症状が出ると考えられます。

共通オプションのセレクト値を変更しても商品ページに反映されない。