csvデータ拝見いたしました。
データの方(01.csv)、問題なく登録できました。こちらでは動作も良好です。今回問題ありませんでしたがデータをエディタで確認すると行の最後にカンマだけのごみが残っていました。エクセルで編集する際は右側のセルを10列ほど削除するとごみが残りません。
さて、ショップに表示されない配送設定ですが、配送設定自体に問題があるのかもしれません。配送設定をもう一度更新してみてください。改善しない場合は、差し支えなければ管理画面に入るための調査用のアカウントをメールで送ってください。